症状として水っぽくて長い便をします。柔らかい粒の時もあります。緑や茶色が混じることがあります。たまに、盲腸便と呼ばれる柔らかめの便をすることもあります。この便を食べてビタミンＢ複合体の補給をします。この場合は病気ではありません。また排泄直後は比較的柔らかく、すぐに堅くなるのが普通です。水溶性の下痢や軟便が続くときはよく注意してください。
湿った干し草、不衛生な飲み水、飲み水の飲み過ぎ、食べ過ぎ、消化不良、異物の摂取、エサが急にかわったとき、急激なダイエット。ベビーのチンチラの場合、食べさせすぎなどが原因になります。また、繊維の少ない，水気の多いエサをやると必ず軟便、下痢になります。新聞紙やダンボール、ペットシーツ、観葉植物、人間のお菓子、脂肪の多い食べ物、古い餌等を囓って下痢をおこすことも多いです。ストレスも原因の一つです。新しい仲間、店での展示、砂浴びが出来なくなる、けんか、温度の急な変化、騒音、振動などがあります。
床に敷く、敷き草が汚れて雑菌が繁殖して、それを食べた場合に下痢をおこすことがあります。敷き草と食用の干し草は、同一のものにしないことと、こまめに取り替えることが大切です。これが原因の場合は、下痢がおさまるまで一時的にチップ材にに変えてみることも方法です（ただしチップ材のアレルギーがおきないことを確認しておく必要があります）。食用の干し草は、高品質でおいしいものを与えて、いつでも食べれるようにしなければいけません。草食動物はいつでも胃腸を働かせるために、干し草をつまんで食べる習性があります。食用干し草がなくなったり、古くなったりすると敷き草を食べはじめますので注意しましょう。
薬より原因を取り除くことが肝心です。エサが原因の場合、干し草(この場合はアルファルファよりも高品質のチモシーロングマットがよい）の一点張りでしばらくしますと、数日で直ることがあります。しかし飲み水は必ず必要です。当分おやつを与えないで新鮮な干し草や新しいペレット（エサ）だけを与えて便が直るのを待ちます。ダイエット中であればエサを制限するのを延期します。下痢の間中はフードを朝と夕方の２回与えます。もみほぐした干し草（アルファルファ）と少量のフランスパンも与えます。カミツレ（植物）のお茶やウイキョウ（植物）のお茶を少量、飲み水に混ぜて与えるのも効果があります（これらのお茶は自然食品のお店や薬局で見つかります）。たいていは１週間くらいで下痢は治まりますので、治まったら通常のフードに戻します。脱水症状が見られるときは電解質ドリンク（ポカリスエット等）を少量与えることも効果があります。人間用の「ビオフェルミン」整腸剤やヨーグルトの併用もいいでしょう。ただし下痢止め薬品には胃腸の消化菌を駄目にする可能性もありますから市販品をやみくもに与えないでください。
下痢が治っても根本的な原因が改善されないと、繰り返してしまいます。ケージやエサの衛生状態、ストレスの要因がないかを再点検しましょう。下痢が治まらないときは、その便を持って動物病院でみてもらいましょう。またベビーチンチラの下痢は、進行が早いと命にかかわることがありますので、早めに獣医さんにみてもらうことをおすすめします。
内部寄生虫や腸内細菌による感染発症による下痢があります。チンチラはもともとこれらの寄生因子や少量の菌を体内（肝臓や腸）にもっています。健康な状態では発症することなく普通に過ごしますが、ストレスがかかって抵抗力が下がると一気に症状がでます。とくにベビーで激しい下痢をおこすと命にかかわることもあります。ベビーのチンチラを購入した時、慢性の下痢が続くときは、動物病院で検便をしてもらい、発見されたら駆除の薬をもらって与えてください。発症が確認されたら、他の動物とは別にして治療させます。糞のなかに原虫がいると他のチンチラは感染することがあるからです。ケージや巣箱、食器をこまめに洗浄消毒するようにします。薬を与えることで約10日で簡単に完治します。ストレスなどの原因がある場合は、それを改善しないと薬だけではなかなか完治しませんので環境もみなおしましょう。
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